O PPGMV possui três áreas de concentração, cada uma com uma linha de pesquisa a saber:
1. Clínica e Cirurgia Animal - Linha de pesquisa: Avaliação e Reparação Clínico-Cirúrgica das Afecções Animais
2. Medicina Veterinária Preventiva - Linha de pesquisa: Epidemiologia, Diagnóstico e Controle das Doenças Infecciosas e Parasitárias e sua Importância em Saúde Pública
3. Reprodução Animal - Linha de pesquisa: Reprodução Animal